Δύο ξεχωριστές προτάσεις κατατέθηκαν στο υπουργείο Παιδείας από το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας και το ΤΕΙ Θεσσαλίας σχετικά με το νέο Πανεπιστήμιο. Η προθεσμία που είχε δώσει το υπουργείο στην τριμερή επιτροπή εξέπνευσε, χωρίς να βγει «λευκός καπνός», μιας και η κάθε πλευρά κατέθεσε τη δική της πρόταση.
Πλέον το υπουργείο από την πλευρά του καλείται να εξετάσει τις προτάσεις και να διαμορφώσει στη συνέχεια μια ενιαία πρόταση που θα τεθεί σε διαβούλευση σχετικά με τον τρόπο συνένωσης του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας και των ΤΕΙ Θεσσαλίας και Στερεάς Ελλάδος.
Σημείο διαφωνίας μεταξύ του Πανεπιστημίου και του ΤΕΙ Θεσσαλίας αποτελεί η έδρα της Γεωπονικής Σχολής.